A Psicopedagogia Clínica ocupa-se primariamente do estudo e tratamento dos processos de aprendizagem de crianças, adolescentes e adultos que apresentam dificuldades ou distúrbios nesta área. Seu objetivo é identificar as causas dos problemas de aprendizagem, que podem estar relacionadas a fatores emocionais, cognitivos, sociais ou biológicos e propor estratégias de intervenção personalizadas que facilitem o desenvolvimento pleno do potencial de aprendizagem do indivíduo.
Por outro lado, a Psicopedagogia Institucional volta-se para a análise e intervenção nos processos educativos realizados em instituições, sejam elas escolas, empresas ou organizações não governamentais. Esse ramo da psicopedagogia procura entender como o contexto institucional influencia a aprendizagem e o desenvolvimento dos sujeitos envolvidos, com o intuito de promover práticas educativas mais inclusivas, democráticas e eficazes.